Han blev magister i Wittenberg

Han tog i 1544 afgangseksamen i filosofi og kort efter magistereksamen.

Han ble 1547 professor pædagogicus i København.

I 1551 er »physicus« Jens Skjelderup assistent hos Peter Capeteyn. Ble 1551 professor i fysikken ved Kjøbenhavns Universitet.

9 Mar 1553 medicinor baccalaureus og 1554 docent mediciner. Han begyndte at læse medicin under sin ansættelse hos Capeteyn og modtog den første licentiatgrad i medicin fra Københavns Universitet. Omtrent samtidig ægtede han Capeteyns datter. Da pestepidemien brød ud, ønskede physicus Skjelderup at blive læge og indtræde i det medicinske fakultet. Hjulpet af sin svigerfar blev han i 1554 immatrikuleret ved Rostock Universitet, hvor han samme år blev dr. med.

Biskop over Bergens Stift fra 1557 til 1582.

Den 19. april 1565, drog han til Danmark, for at hente arven efter sin faders død, og var udi stor livsfare "under Jullandt". Den 25. juli 1565, kom han tilbage fra Danmark hen mod aften, "kom fra Randers til Skien, oc siden til lands indtil Hardanger, oc saa til Byen." At han rejste fra Randers kunne indikere, at hans familie stammede fra Skjellerup by ved Hobro, ikke langt fra Randers.